來自美國加州的消息，癌癥基因組圖譜研究（Cancer Genome Atlas，TCGA）項目組公布了一項癌癥基因組最大規(guī)模研究結(jié)果，研究人員在多個基因組技術(shù)平臺上分析了超過3500個腫瘤，從中發(fā)現(xiàn)了一種能區(qū)分癌癥的新方法。

這一同領(lǐng)域最大規(guī)模的研究成果公布在8月7日的Cell雜志上，領(lǐng)導這一研究的是加州大學圣克魯茲分校Buck研究所Christopher Benz和 Christina Yau。

2007年，美國國立衛(wèi)生研究院NIH宣布進行為期兩年、總值340萬美元的癌癥基因組圖譜研究計劃（Cancer Genome Atlas pilot program），這一計劃目標是“測試一種大規(guī)模、系統(tǒng)性分析癌細胞基因組變化的方法的可行性”，為檢測、治療、預防癌癥提供基因組信息。

在過去的幾年里，這一項目陸續(xù)獲得了一些研究成果，而在最新這項研究中，研究人員采用6種不同的TCGA“平臺技術(shù)（platform technologies）”，分析了12種不同腫瘤類型樣品的DNA，RNA和蛋白，希望能從中發(fā)現(xiàn)不同類型的腫瘤如何相互區(qū)分。

研究結(jié)果表明相對于癌癥起源的組織類型，如乳房腎臟、膀胱等，相同癌癥起源的細胞類型具有更多分子和遺傳上的相似性。

文章的通訊作者Benz指出，我們組織中大部分是由許多不同類型的上皮細胞和非上皮細胞組成，“這項顛覆性的基因組研究不僅挑戰(zhàn)了基于組織類型的現(xiàn)有癌癥分類系統(tǒng)，而且還提供了能用于進一步研究的大量新數(shù)據(jù)來源，以及能用于區(qū)分每種新描述癌癥類型的分子特征整體列表，”Benz說，“比如說膀胱癌能重新被分成幾種不同的癌癥類型，每一種都具有不同的臨床表征，這就有助于解釋對看似相同的癌癥類型進行相同的全身療法治療，為什么患者往往反應截然不同”。

這一研究組發(fā)現(xiàn)在十個癌癥患者中至少有一個能通過這種新系統(tǒng)分類到不同的癌癥類型中，而且Benz認為如果他們下一輪進行更多的樣品，和腫瘤類型的分析，將會有更多的腫瘤需要重新分類，他預計下一輪將進行超過20種不同腫瘤類型的分析。

“考慮到這種多平臺類型基因組分析的潛力，我們還只是分析了冰山的一角。未來可能還有多達30%或 50%的癌癥需要被重新歸類”。

在這項研究中，最引人注目的發(fā)現(xiàn)就是膀胱癌和乳腺癌方面的成果，至少有三個不同亞型的膀胱癌需要重新分類：一種是無法與肺腺癌區(qū)分開來的亞型，一種是與起源自頭部，頸部和肺部的鱗狀上皮細胞癌很相似的亞型。

這項研究也指出和證實了乳腺癌類型中已知的差異，而且還揭示出了新的令人驚訝的發(fā)現(xiàn)——基底樣乳腺癌實際上是一類新癌癥類型。

基底樣乳腺癌（Basal-like breast cancers）通常稱為三陰性乳腺癌（triple-negative breast cancer），是一種特別具有侵襲性，并致命的癌癥。“即使這些基底樣癌癥出現(xiàn)在乳腺中，但在分子水平上它們與卵巢癌和鱗狀上皮細胞起源的癌癥更為相似，”Yau說。

Benz認為這一研究將能被用于臨床試驗設(shè)計，尤其是希望能通過腫瘤基因組重分類，尋找新的治療方法的患者，“雖然需要后續(xù)的研究來驗證，并完善這一新提出的癌癥分類系統(tǒng)，但是這項研究最終將能為個性化癌癥醫(yī)療時代的到來，奠定基礎(chǔ)生物學基礎(chǔ)。”